O risco eminente do vírus da febre aftosa fez com que o Paraná e Santa Catarina unissem forças no combate a doença. As secretarias de Agricultura dos dois estados definiram medidas de fiscalização. Entre as ações estão a otimização dos recursos em barreiras fixas, fiscalização na fronteira com São Paulo e Mato Grosso do Sul, monitoramento das propriedades problemáticas, desenvolvimento de um banco de dados do sistema de trânsito paranaense entre Mato Grosso do Sul, Santa Catarina e Rio Grande do Sul, entre outras medidas. Santa Catarina é o único estado brasileiro certificado pela Orga­­ni­­zação Mundial de Saúde Animal como livre da doença sem vacinação. O Paraná tem como meta al­­cançar esse status em 2013.