A obtenção de mudas de alta qualidade é fator determinante no sucesso da produção. Problemas que ocorrem na fase de produção de mudas serão evidenciados na planta adulta, quando dificilmente poderão ser corrigidos. O processo de produção de mudas é favorecido, sempre que feito em abrigos de cultivo, uma tecnologia que torna o ambiente mais favorável para a parte aérea e as raízes das plantas. É sugerido um abrigo com pés-direitos laterais de 3,0m de altura e 4,5m na cumeeira. É importante o revestimento com telas anti-insetos, inclusive nos oitões, para facilitar a ventilação e evitar insetos-praga. Contudo, mesmo assim, é imprescindível o uso de um termo-higrômetro para o monitoramento da temperatura e umidade relativa do ar para uma tomada de decisão mais precisa em casos extremos, principalmente de temperatura.
Escolha do material genético para cultivo
De maneira geral, pode-se dividir as sementes em dois grupos: híbridos e variedades. A correta escolha do material genético talvez seja a decisão mais importante e impactante para o sucesso do cultivo.
Os híbridos são mais produtivos que as variedades e apresentam resistência genética a diversas pragas e doenças (Tabela 3), o que favorece a sua escolha pelo produtor. Existe uma infinidade de híbridos e empresas no mercado de sementes de híbridos de tomate, os quais atendem diferentes demandas em todo o território nacional.
Na maioria dos casos, esses híbridos são obtidos pelo sistema convencional de produção de sementes, passando pelo processo de tratamento químico com agrotóxicos antes do envelopamento. Porém, segundo a Instrução Normativa Nº 38 de 02 de Agosto de 2011 (Sementes e Mudas Orgânicas), capítulo III, art.8, caso o produtor de sementes e mudas orgânicas necessite adquirir material de propagação oriundo de sistemas de produção convencional, ele terá que respeitar um período de conversão que compreende uma geração completa com manejo orgânico para culturas anuais, além de dois períodos vegetativos ou 12 meses (considerando o período mais longo) para as culturas perenes, para que a semente ou muda produzida possa ser considerada orgânica. Contudo, devido à falta de material genético disponível para o cultivo de tomate orgânico, o Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento (Mapa), que regulamenta a agricultura orgânica, permitiu a utilização de sementes híbridas de tomate, com último prazo para adequação dos produtores para 2018. Assim, enquanto não houver alteração nas normas, o produtor poderá utilizar sementes híbridas advindas do sistema convencional.

O lançamento de variedades, por sua vez, não é o objetivo das empresas de melhoramento, que preferem resguardar o material genético para si por meio do uso de híbridos. Assim, remanescem hoje no mercado poucas e antigas variedades de polinização aberta lançadas nas décadas passadas, muitas vezes pouco produtivas quando comparadas com os híbridos.
Para atender essa demanda, desde o ano 2000, o Programa de Pesquisa em Hortaliças da Epagri de Itajaí avaliou 57 acessos de tomate de polinização aberta, quanto a produtividade, incidência de insetos-praga e doenças e qualidade dos frutos. Num processo de seleção ao longo dos anos, chegou-se em um cultivar com características de interesse para cultivo no sistema orgânico e, em outubro de 2016, foi lançado com o nome de SCS375 Kaiçara. A Epagri abriu em janeiro de 2019 oferta pública para identificar empresas interessadas em produzir e comercializar a semente do ‘Kaiçara’. A empresa Isla Sementes Ltda. adquiriu o direito de comercialização até o ano de 2024.
A planta do cultivar SCS375 Kaiçara é de crescimento indeterminado, com entrenó médio, ausência de abscisão do pedúnculo, folhas curtas, horizontais e de largura média (Tabela 4). Apresenta características desejáveis do ponto de vista de facilidade nos tratos culturais e manejo fitossanitário, melhorando também a aeração do cultivo e propiciando condições desfavoráveis para o surgimento de doenças foliares (Figura 11).


Texto retirado do artigo: Tomatorg: Sistema Orgânico de Produção de Tomates em Santa Catarina
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