Apesar de serem de ciclo rápido, as Hortaliças podem ser atacadas por várias pragas, como formigas, lagartas e insetos, e também por doenças causadas por fungos, bactérias, vírus e nematóides. A tendência da maior parte dos horticultores é usar agrotóxicos para resolver rapidamente o problema, o que pode ter conseqüências graves. Uma das maiores dificuldades do cultivo em pequenas áreas, como em hortas, é saber como identificar o problema e sua causa, o que é geralmente feito com sucesso apenas por especialistas ou profissionais com larga experiência.